县卫健委主要职责是：
（一）组织拟订伊吾县卫生健康政策，拟订伊吾县卫生健康事业发展政策、规划和标准并组织实施。统筹规划卫生健康资源配置，推进卫生健康科技创新发展，指导区域卫生健康规划的编制和实施，贯彻落实推进卫生健康基本公共服务均等化、普惠化、便捷化和公共资源向基层延伸等政策措施。
（二）协调推进深化医药卫生体制改革，研究提出深化医药卫生体制改革重大方针、政策、措施的建议。组织深化公立医院综合改革，推进管办分离，健全现代医院管理制度，贯彻落实国家、自治区、哈密市推动卫生健康公共服务提供主体多元化、提供方式多样化的政策措施，研究提出医疗服务等政策的建议。
（三）负责卫生应急工作，承担全县医疗卫生应急体系建设，牵头组织协调传染病疫情应对工作，组织指导全县传染病以外的其他突发公共卫生事件预防控制和各类突发公共事件医疗卫生救援。
（四）组织开展卫生健康宣传、健康促进活动，协调推进健康伊吾战略实施，严格落实自治区《烟草控制框架公约》有关工作。
（五）负责推进老年健康服务体系建设和医养结合工作。
（六）贯彻落实国家药物政策和国家基本药物制度，开展药品使用监测、临床综合评价和短缺药品预警。执行国家药品法典和自治区基本药物价格政策。组织开展食品安全风险监测评估。
（七）贯彻落实职责范围内的职业卫生、放射卫生相关政策措施，推进职业健康管理体系建设，指导基层开展职业卫生、放射卫生的管理。协调开展职业病防治工作。
（八）负责全县医疗卫生、计划生育等综合行政执法职责。落实自治区医疗机构、医疗服务行业管理办法并监督实施，建立医疗服务评价和监督管理体系。负责卫生健康专业技术人员资格管理。组织实施医疗服务规范、标准和卫生健康专业技术人员执业规则、服务规范。
（九）负责优化生育管理和服务工作，开展人口监测预警，研究提出人口与家庭发展相关政策建议，完善计划生育政策。协调推进托育服务发展工作。指导伊吾县计划生育协会的业务工作。
（十）贯彻落实党和国家有关中医药（含中西医结合与少数民族医药，下同）事业发展的法律法规和政策，负责全县中医医疗、预防、保健、康复及临床用药等监督管理，健全中医药服务体系，统筹中西医发展，指导推进基层中医药服务能力建设，推进中医药传承和创新。
（十一）指导全县基层医疗卫生、妇幼健康服务体系和全科医生队伍建设等工作。推进卫生健康科技创新发展。
（十二）贯彻执行自治区传染病预防控制及公共卫生监督的地方性法规、政府规章、政策、规划、标准，负责全县疾病预防控制网络和工作体系建设。领导全县疾病预防控制机构业务工作，制定监督检查和考核评价办法并组织实施。审核县疾病预防控制局的监测预警等规划计划和应急预案，指导开展监测预警、免疫规划和隔离防控等相关工作，建立上下联动的分工协作机制。制定并组织落实全县免疫规划以及严重危害人民健康公共卫生问题的干预措施，负责预防接种监督管理工作，执行国家检疫、监测传染病目录，提出法定传染病病种调整建议。统筹规划并监督管理全县医疗机构疾病预防控制工作，指导建立疾病预防控制监督员制度并组织实施，制定疾病预防控制系统队伍建设的政策并组织实施。规划指导全县传染病疫情监测预警体系建设，组织开展疫情监测、风险评估工作并发布疫情信息，建立健全跨部门、跨区域的疫情信息通报和共享机制。负责传染病疫情应对相关工作，组织开展流行病学调查、检验检测、应急处置等工作，拟订应急预案并组织开展演练，指导疾病预防控制系统应急体系和能力建设，负责县本级应急队伍、志愿者队伍建设，提出传染病疫情应对应急物资需求及分配意见。负责全县传染病防治、环境卫生、学校卫生、公共场所卫生、饮用水卫生监督管理和职业卫生、放射卫生监督工作，组织查处重大违法行为，健全全县卫生健康综合监督体系。
（十三）负责保健对象的医疗保健工作，负责县重要会议与重大活动的医疗卫生保障工作。
（十四）完成县委、县人民政府交办的其他任务。
县卫健委设下列股级内设机构：
（一）综合办公室。负责机关日常运转工作。综合协调机关政务、事务工作。组织协调机关和所属事业单位业务开展，督促重大事项的落实。负责文电、会务、机要、档案、保密、信访、重要文稿起草、接待、后勤、应急管理、综合治理、安全保卫、政务公开等机关日常工作。承担机关和所属单位的干部人事、机构编制、队伍建设和绩效管理等工作，组织拟订卫生健康系统内部财务管理规章制度，承担机关和预算管理单位的预决算、财务、固定资产管理、劳动工资和审计工作；负责新闻宣传、信息、对外宣传工作。负责县本级卫生健康领域基本建设项目的申报、评估和管理。承担统筹管理和监督卫生健康专项资金以及组织开展绩效评价的工作。负责办理人大代表建议和政协委员提案的答复。
负责机关和所属事业单位党的建设、党风廉政建设以及意识形态工作，领导机关群团组织的工作。
（二）综合业务办公室。承担协调推进健康新疆战略和健康伊吾建设工作；拟订卫生健康教育、健康促进规划和规范并组织实施；拟订并组织实施卫生健康科技发展规划及相关政策；统筹规划并实施卫生健康资源配置；组织开展卫生健康宣传、健康教育、健康促进活动，承担卫生健康科学普及、舆情监控、新闻和信息发布工作。负责拟订年度爱国卫生工作目标和工作计划，组织开展爱国卫生运动、卫生健康统计和各级各类卫生创建活动；指导城乡实施环境卫生整治、健康教育、农村改厕，并督促落实；落实自治区《烟草控制框架公约》履约有关工作。
指导和推进全县卫生应急体系和能力建设，组织协调传染病疫情应对工作。承担各类突发公共事件的紧急医学救援工作。组织编制卫生应急专项预案，承担预案演练组织实施和指导监督工作。指导开展紧急医学救援基地建设。拟订重大疾病、慢性病防控管理政策规范并监督实施。指导和推进全县安全生产管理体系建设，负责全县卫健系统安全生产统筹、监督和指导工作。
负责拟订全县基层卫生健康政策、标准和规范的组织实施，指导推进基层卫生健康服务体系建设工作；监督指导基层卫生健康政策落实。承担全县国家基本公共卫生服务项目的综合管理工作。指导全县基层医疗机构专业技术人员队伍建设，开展基层医疗卫生机构标准化建设和服务能力提升工作。组织实施全民健康体检工作，完善家庭医生签约服务工作机制。负责保健对象的医疗保健工作。承担建立和完善老年健康服务体系工作，协调推进老年健康教育、预防保健、疾病诊治、康复护理、长期照护、安宁疗护等工作。组织拟订和实施医养结合的政策、标准和规范，落实医养结合政策保障制度，开展医养结合督导检查、考核评价和数据监测工作。
贯彻执行国家、自治区关于医疗机构及医务人员、医疗技术应用、医疗质量和安全、医疗服务、采供血机构以及行风建设等行业管理政策规范、标准。拟订全县卫生健康人才发展政策，组织开展住院医师、专科医师培训等毕业后医学教育、继续教育和乡村医生管理工作，协同指导医学类教育工作。组织实施卫生人才援疆工作，负责对全县内医疗机构执业许可证、诊所备案证的核发。负责区域内医师、护士执业注册。负责县二级以下医疗机构审批。拟订公立医院运行监管、绩效评价和考核制度。负责重要会议和重大活动的医疗卫生保障工作。负责卫生健康专业技术人员资格管理。指导并督促县域内医联（共）体建设。承担深化医药卫生体制改革具体工作，研究提出深化医药卫生体制改革措施的建议，承担组织推进公立医院综合改革工作。负责区域内血量调剂工作，保证在出现突发事件时临床应急用血。
拟订县中医药事业中长期发展规划，组织开展县中药资源普查，促进中药资源的保护、开发和合理利用工作。指导中医药与健康旅游、健康养老、养生保健等相关领域融合发展。承担深化中医药医改相关工作。拟订县中医药防治重大疾病规划并组织实施。负责中医、中西医结合和少数民族医疗机构及医务人员、医疗技术应用、医疗质量、医疗安全、医疗服务、行风建设、绩效评价等行业管理政策规范、标准并监督实施。指导全县中医药服务体系、应急体系和能力建设，组织开展传染病和突发事件中医药应急工作。拟订县中医药人才发展规划、各类中医药教育发展规划并组织实施，负责中医药师承教育和相关人才培训工作。贯彻落实国家、自治区药物政策和国家基本药物制度，执行国家药品法典和国家、自治区基本药物目录，贯彻落实自治区药物使用的相关政策措施，配合开展药品使用监测、临床综合评价和短缺药品预警与应对处置。组织拟订县卫生健康事业发展中长期规划并实施，指导卫生健康服务体系、信息化和卫生健康统计工作。
承担人口监测预警、统计分析工作和计划生育综合行政执法工作并提出人口与家庭发展相关政策建议。参与制定人口发展规划和政策，优化完善生育政策及配套支持措施，坚持完善优化生育政策目标管理责任制，指导督促基层加强优化生育政策工作网络建设和服务管理。组织实施优化生育政策宣传咨询服务。落实和组织实施计划生育家庭扶助制度，组织实施和完善托育服务发展的政策规范，承担协调推进托育服务发展工作。
拟订妇幼卫生健康政策、标准和规范并组织实施。推进妇幼卫生健康服务体系建设，建立健全以妇幼保健机构为主体，以基层医疗卫生机构为基础，综合医院为补充的妇幼保健服务体系。指导妇幼卫生、出生缺陷防治、婴幼儿早期发展、生育技术服务等工作，依法规范母婴保健服务。负责《出生医学证明》事务性管理工作。负责指导基层开展孕产妇系统管理和儿童系统管理工作。
（三）疾病预防和卫生应急办公室。负责组织开展传染病防控效果评估，指导医疗机构开展疾病预防控制工作。组织落实国家免疫规划、全县预防接种服务体系及其信息系统建设工作，组织疫苗针对传染病防控的免疫效果评估；指导实施环境卫生、学校卫生、公共场所卫生、饮用水卫生管理政策；负责职业卫生健康机关政策、标准的实施，承担职责范围内职业卫生、放射卫生的管理。拟订意外伤害相关预防措施。建立疫情信息通报和共享机制，规划指导监测预警体系建设和完善传染病疫情网络直报系统，指导医疗机构等落实传染病疫情信息报告责任。承担全县传染病疫情应急相关工作，组织编制应急预案并开展演练，承担应急体系、能力及队伍建设工作，提出相关应急物资储备品种、数量等建议，以及应急状态下物资需求和分配意见。承担全县医疗机构疾病预防控制和公共卫生监督工作，组织对医疗机构开展疾病预防控制工作的督导、检查和考核，依法组织查处传染病防治重大违法行为，指导建立疾病预防控制监督员制度；组织指导开展职业卫生、放射卫生、学校卫生、公共场所卫生、饮用水卫生监督检查工作，组织开展食品安全风险监测评估，完善卫生健康综合监督体系。承担规范性文件的合法性审核和行政应诉、普法等工作。
